track name='QIAseq_RNA_panel.RHS-003Z' chr1 3707733 3722054 ENSG00000078900/TP73 0 + 3707733 3707733 0 2 58,34 0,14287 chr1 6628529 6628648 ENSG00000041988/THAP3 0 + 6628529 6628529 0 1 119 0 chr1 8865351 8865446 ENSG00000074800/ENO1 0 - 8865351 8865351 0 1 95 0 chr1 10469177 10469272 ENSG00000160049/DFFA 0 - 10469177 10469177 0 1 95 0 chr1 11126682 11126777 ENSG00000198793/MTOR 0 - 11126682 11126682 0 1 95 0 chr1 11674660 11674753 ENSG00000116670/MAD2L2 0 - 11674660 11674660 0 1 93 0 chr1 15518169 15518271 ENSG00000132906/CASP9 0 - 15518169 15518169 0 1 102 0 chr1 20483599 20483695 ENSG00000162545/CAMK2N1 0 - 20483599 20483599 0 1 96 0 chr1 25901534 25901635 ENSG00000117632/STMN1 0 - 25901534 25901534 0 1 101 0 chr1 39743264 39743892 ENSG00000084072/PPIE 0 + 39743264 39743264 0 2 33,69 0,559 chr1 42925590 42925685 ENSG00000117394/SLC2A1 0 - 42925590 42925590 0 1 95 0 chr1 43360856 43360950 ENSG00000117399/CDC20 0 + 43360856 43360856 0 1 94 0 chr1 46260915 46261009 ENSG00000085999/RAD54L 0 + 46260915 46260915 0 1 94 0 chr1 63660076 63660171 ENSG00000079739/PGM1 0 + 63660076 63660076 0 1 95 0 chr1 67687683 67687773 ENSG00000116717/GADD45A 0 + 67687683 67687683 0 1 90 0 chr1 94533089 94533184 ENSG00000117525/F3 0 - 94533089 94533089 0 1 95 0 chr1 104793033 104793128 _GDC_CONTROL_07_/_GDC_CONTROL_07_ 0 + 104793033 104793033 0 1 95 0 chr1 111712597 111712692 ENSG00000116473/RAP1A 0 + 111712597 111712597 0 1 95 0 chr1 145995185 145995276 ENSG00000265972/TXNIP 0 - 145995185 145995185 0 1 91 0 chr1 150577272 150577367 ENSG00000143384/MCL1 0 - 150577272 150577272 0 1 95 0 chr1 154974788 154974884 ENSG00000173207/CKS1B 0 + 154974788 154974788 0 1 96 0 chr1 155134716 155134810 ENSG00000169242/EFNA1 0 + 155134716 155134716 0 1 94 0 chr1 155290335 155290430 ENSG00000143627/PKLR 0 - 155290335 155290335 0 1 95 0 chr1 172665679 172665773 ENSG00000117560/FASLG 0 + 172665679 172665679 0 1 94 0 chr1 186675921 186676017 ENSG00000073756/PTGS2 0 - 186675921 186675921 0 1 96 0 chr1 192811435 192811530 ENSG00000116741/RGS2 0 + 192811435 192811435 0 1 95 0 chr1 207065039 207065143 ENSG00000123836/PFKFB2 0 + 207065039 207065039 0 1 104 0 chr1 226361053 226361148 ENSG00000143799/PARP1 0 - 226361053 226361053 0 1 95 0 chr1 241866950 241867045 ENSG00000174371/EXO1 0 + 241866950 241866950 0 1 95 0 chr10 6220660 6220762 ENSG00000170525/PFKFB3 0 + 6220660 6220660 0 1 102 0 chr10 17237289 17237388 ENSG00000026025/VIM 0 + 17237289 17237289 0 1 99 0 chr10 22329526 22329621 ENSG00000168283/BMI1 0 + 22329526 22329526 0 1 95 0 chr10 33330732 33330827 ENSG00000099250/NRP1 0 - 33330732 33330732 0 1 95 0 chr10 35010347 35010442 ENSG00000108094/CUL2 0 - 35010347 35010347 0 1 95 0 chr10 44378681 44380817 ENSG00000107562/CXCL12 0 - 44378681 44378681 0 2 42,55 0,2081 chr10 49483418 49483513 ENSG00000225830/ERCC6 0 - 49483418 49483418 0 1 95 0 chr10 60784723 60784818 ENSG00000170312/CDK1 0 + 60784723 60784723 0 1 95 0 chr10 69379878 69379977 ENSG00000156515/HK1 0 + 69379878 69379878 0 1 99 0 chr10 72275607 72275702 ENSG00000168209/DDIT4 0 + 72275607 72275607 0 1 95 0 chr10 73008176 73008271 ENSG00000122884/P4HA1 0 - 73008176 73008176 0 1 95 0 chr10 73122188 73122283 ENSG00000166321/NUDT13 0 + 73122188 73122188 0 1 95 0 chr10 73917043 73917140 ENSG00000122861/PLAU 0 + 73917043 73917043 0 1 97 0 chr10 89003032 89003127 ENSG00000026103/FAS 0 + 89003032 89003032 0 1 95 0 chr10 91841311 91841405 ENSG00000107854/TNKS2 0 + 91841311 91841311 0 1 94 0 chr10 97465858 97465949 ENSG00000155229/MMS19 0 - 97465858 97465858 0 1 91 0 chr10 101582800 101582890 ENSG00000166169/POLL 0 - 101582800 101582800 0 1 90 0 chr10 103900087 103900190 ENSG00000107960/OBFC1 0 - 103900087 103900087 0 1 103 0 chr10 110279186 110279279 ENSG00000119950/MXI1 0 + 110279186 110279186 0 1 93 0 chr10 113721658 113721752 ENSG00000165806/CASP7 0 + 113721658 113721658 0 1 94 0 chr10 125831419 125831513 ENSG00000107949/BCCIP 0 + 125831419 125831419 0 1 94 0 chr10 128109089 128109184 ENSG00000148773/MKI67 0 - 128109089 128109089 0 1 95 0 chr10 129767128 129767221 ENSG00000170430/MGMT 0 + 129767128 129767128 0 1 93 0 chr10 131967540 131967643 ENSG00000176171/BNIP3 0 - 131967540 131967540 0 1 103 0 chr11 9575995 9576090 ENSG00000166483/WEE1 0 + 9575995 9575995 0 1 95 0 chr11 10307274 10307369 ENSG00000148926/ADM 0 + 10307274 10307274 0 1 95 0 chr11 18408109 18408204 ENSG00000134333/LDHA 0 + 18408109 18408109 0 1 95 0 chr11 47237883 47237978 ENSG00000134574/DDB2 0 + 47237883 47237883 0 1 95 0 chr11 60936354 60936444 ENSG00000006118/TMEM132A 0 + 60936354 60936354 0 1 90 0 chr11 61313498 61313593 ENSG00000167986/DDB1 0 - 61313498 61313498 0 1 95 0 chr11 61796494 61796588 ENSG00000168496/FEN1 0 + 61796494 61796494 0 1 94 0 chr11 62536089 62536556 ENSG00000124942/AHNAK 0 - 62536089 62536089 0 2 9,88 0,379 chr11 66871459 66871770 ENSG00000173599/PC 0 - 66871459 66871459 0 2 21,84 0,227 chr11 67397816 67397916 ENSG00000172613/RAD9A 0 + 67397816 67397816 0 1 100 0 chr11 69651552 69651647 ENSG00000110092/CCND1 0 + 69651552 69651552 0 1 95 0 chr11 94460935 94461030 ENSG00000020922/MRE11A 0 - 94460935 94460935 0 1 95 0 chr11 102324784 102324879 ENSG00000023445/BIRC3 0 + 102324784 102324784 0 1 95 0 chr11 102350217 102350312 ENSG00000110330/BIRC2 0 + 102350217 102350217 0 1 95 0 chr11 102843558 102843654 ENSG00000149968/MMP3 0 - 102843558 102843558 0 1 96 0 chr11 105026332 105026922 ENSG00000137752/CASP1 0 - 105026332 105026332 0 2 24,81 0,509 chr11 108304693 108304788 ENSG00000149311/ATM 0 + 108304693 108304693 0 1 95 0 chr11 125633207 125633304 ENSG00000149554/CHEK1 0 + 125633207 125633207 0 1 97 0 chr11 128462132 128462226 ENSG00000134954/ETS1 0 - 128462132 128462132 0 1 94 0 chr12 916764 925486 ENSG00000002016/RAD52 0 - 916764 916764 0 2 56,37 0,8685 chr12 1646507 1646602 ENSG00000111186/WNT5B 0 + 1646507 1646507 0 1 95 0 chr12 4301485 4301580 ENSG00000118971/CCND2 0 + 4301485 4301485 0 1 95 0 chr12 6333415 6333511 ENSG00000067182/TNFRSF1A 0 - 6333415 6333415 0 1 96 0 chr12 6868903 6869124 ENSG00000111669/TPI1 0 + 6868903 6868903 0 2 84,26 0,195 chr12 6919608 6919713 ENSG00000111674/ENO2 0 + 6919608 6919608 0 1 105 0 chr12 7936028 7936128 ENSG00000059804/SLC2A3 0 - 7936028 7936028 0 1 100 0 chr12 12721078 12721173 ENSG00000111276/CDKN1B 0 + 12721078 12721078 0 1 95 0 chr12 21635373 21635466 ENSG00000111716/LDHB 0 - 21635373 21635373 0 1 93 0 chr12 48130385 48131359 ENSG00000152556/PFKM 0 + 48130385 48130385 0 2 51,44 0,930 chr12 48716559 48716653 ENSG00000129315/CCNT1 0 - 48716559 48716559 0 1 94 0 chr12 51922495 51922590 ENSG00000139567/ACVRL1 0 + 51922495 51922495 0 1 95 0 chr12 53382547 53382647 ENSG00000185591/SP1 0 + 53382547 53382547 0 1 100 0 chr12 54181496 54181590 ENSG00000123415/SMUG1 0 - 54181496 54181496 0 1 94 0 chr12 54396067 54396172 ENSG00000161638/ITGA5 0 - 54396067 54396067 0 1 105 0 chr12 55968850 55968945 ENSG00000123374/CDK2 0 + 55968850 55968850 0 1 95 0 chr12 56664302 56664403 ENSG00000110958/PTGES3 0 - 56664302 56664302 0 1 101 0 chr12 57750935 57751038 ENSG00000135446/CDK4 0 - 57750935 57750935 0 1 103 0 chr12 68159578 68159673 ENSG00000111537/IFNG 0 - 68159578 68159578 0 1 95 0 chr12 68839740 68839835 ENSG00000135679/MDM2 0 + 68839740 68839740 0 1 95 0 chr12 98648367 98648462 ENSG00000120868/APAF1 0 + 98648367 98648367 0 1 95 0 chr12 102419591 102475652 ENSG00000017427/IGF1 0 - 102419591 102419591 0 2 99,10 0,56051 chr12 103987237 103987333 ENSG00000139372/TDG 0 + 103987237 103987237 0 1 96 0 chr12 109110692 109110787 ENSG00000076248/UNG 0 + 109110692 109110692 0 1 95 0 chr12 119681140 119681238 ENSG00000111725/PRKAB1 0 + 119681140 119681140 0 1 98 0 chr12 122572955 122573050 ENSG00000184445/KNTC1 0 + 122572955 122572955 0 1 95 0 chr12 132583936 132584035 ENSG00000112787/FBRSL1 0 + 132583936 132583936 0 1 99 0 chr13 26349083 26349178 ENSG00000132964/CDK8 0 + 26349083 26349083 0 1 95 0 chr13 28431150 28431245 ENSG00000102755/FLT1 0 - 28431150 28431150 0 1 95 0 chr13 32398560 32398660 ENSG00000139618/BRCA2 0 + 32398560 32398560 0 1 100 0 chr13 48307286 48307380 ENSG00000139687/RB1 0 + 48307286 48307286 0 1 94 0 chr13 102875460 102875555 ENSG00000134899/ERCC5 0 + 102875460 102875460 0 1 95 0 chr13 106512673 106512768 ENSG00000125266/EFNB2 0 - 106512673 106512673 0 1 95 0 chr13 108210933 108211028 ENSG00000174405/LIG4 0 - 108210933 108210933 0 1 95 0 chr13 113640920 113641015 ENSG00000198176/TFDP1 0 + 113640920 113640920 0 1 95 0 chr13 114272207 114272302 ENSG00000130177/CDC16 0 + 114272207 114272207 0 1 95 0 chr14 20354106 20354201 ENSG00000129484/PARP2 0 + 20354106 20354106 0 1 95 0 chr14 20406257 20406354 ENSG00000129566/TEP1 0 - 20406257 20406257 0 1 97 0 chr14 20457396 20457491 ENSG00000100823/APEX1 0 + 20457396 20457396 0 1 95 0 chr14 20693867 20693957 ENSG00000214274/ANG 0 + 20693867 20693867 0 1 90 0 chr14 22836613 22836714 ENSG00000157227/MMP14 0 + 22836613 22836613 0 1 101 0 chr14 24099710 24100108 ENSG00000100889/PCK2 0 + 24099710 24099710 0 2 10,114 0,284 chr14 24240485 24240589 ENSG00000092330/TINF2 0 - 24240485 24240485 0 1 104 0 chr14 54411581 54411674 ENSG00000100526/CDKN3 0 + 54411581 54411581 0 1 93 0 chr14 55142652 55142748 ENSG00000131981/LGALS3 0 + 55142652 55142652 0 1 96 0 chr14 58465870 58465965 ENSG00000100578/KIAA0586 0 + 58465870 58465870 0 1 95 0 chr14 60796217 60796319 ENSG00000020426/MNAT1 0 + 60796217 60796217 0 1 102 0 chr14 61736940 61737035 ENSG00000100644/HIF1A 0 + 61736940 61736940 0 1 95 0 chr14 67887103 67887198 ENSG00000182185/RAD51B 0 + 67887103 67887103 0 1 95 0 chr14 74942112 74942208 ENSG00000119630/PGF 0 - 74942112 74942112 0 1 96 0 chr14 75047512 75047607 ENSG00000119684/MLH3 0 - 75047512 75047512 0 1 95 0 chr14 94768437 94768529 ENSG00000133937/GSC 0 - 94768437 94768437 0 1 92 0 chr14 102081277 102081372 ENSG00000080824/HSP90AA1 0 - 102081277 102081277 0 1 95 0 chr14 103711065 103711160 ENSG00000126215/XRCC3 0 - 103711065 103711065 0 1 95 0 chr14 104770789 104772411 ENSG00000142208/AKT1 0 - 104770789 104770789 0 2 58,47 0,1575 chr15 34341938 34342028 ENSG00000182117/NOP10 0 - 34341938 34341938 0 1 90 0 chr15 39598650 39598745 ENSG00000137801/THBS1 0 + 39598650 39598650 0 1 95 0 chr15 40701092 40701187 ENSG00000051180/RAD51 0 + 40701092 40701092 0 1 95 0 chr15 40938113 40938213 ENSG00000128917/DLL4 0 + 40938113 40938113 0 1 100 0 chr15 43456907 43457002 ENSG00000067369/TP53BP1 0 - 43456907 43456907 0 1 95 0 chr15 46219595 46219689 _GDC_CONTROL_32_/_GDC_CONTROL_32_ 0 + 46219595 46219595 0 1 94 0 chr15 59116816 59116911 ENSG00000157456/CCNB2 0 + 59116816 59116816 0 1 95 0 chr15 60347438 60347567 ENSG00000182718/ANXA2 0 - 60347438 60347438 0 1 129 0 chr15 72208641 72208759 ENSG00000067225/PKM 0 - 72208641 72208641 0 1 118 0 chr15 75352110 75352200 ENSG00000140398/NEIL1 0 + 75352110 75352110 0 1 90 0 chr15 79970828 79970922 ENSG00000140379/BCL2A1 0 - 79970828 79970828 0 1 94 0 chr15 90231407 90231502 ENSG00000185043/CIB1 0 - 90231407 90231407 0 1 95 0 chr15 90763014 90763109 ENSG00000197299/BLM 0 + 90763014 90763014 0 1 95 0 chr15 94718874 94718968 _GDC_CONTROL_24_/_GDC_CONTROL_24_ 0 + 94718874 94718874 0 1 94 0 chr15 98922260 98922355 ENSG00000140443/IGF1R 0 + 98922260 98922260 0 1 95 0 chr16 83099 83226 ENSG00000103152/MPG 0 + 83099 83099 0 1 127 0 chr16 634501 634622 ENSG00000130731/C16orf13 0 - 634501 634501 0 1 121 0 chr16 2044738 2046165 ENSG00000065057/NTHL1 0 - 2044738 2044738 0 2 62,38 0,1389 chr16 2457797 2457892 ENSG00000162063/CCNF 0 + 2457797 2457797 0 1 95 0 chr16 13928027 13928122 ENSG00000175595/ERCC4 0 + 13928027 13928027 0 1 95 0 chr16 23683946 23684041 ENSG00000166851/PLK1 0 + 23683946 23683946 0 1 95 0 chr16 30070127 30070225 ENSG00000149925/ALDOA 0 + 30070127 30070127 0 1 98 0 chr16 50749907 50750002 ENSG00000083799/CYLD 0 + 50749907 50749907 0 1 95 0 chr16 53453471 53453566 ENSG00000103479/RBL2 0 + 53453471 53453471 0 1 95 0 chr16 55485308 55485400 ENSG00000087245/MMP2 0 + 55485308 55485308 0 1 92 0 chr16 66386927 66387031 ENSG00000179776/CDH5 0 + 66386927 66386927 0 1 104 0 chr16 67175154 67175251 ENSG00000140939/NOL3 0 + 67175154 67175154 0 1 97 0 chr16 67198777 67198873 ENSG00000205250/E2F4 0 + 67198777 67198777 0 1 96 0 chr16 67658316 67658613 ENSG00000102977/ACD 0 - 67658316 67658316 0 2 46,59 0,238 chr16 68801743 68801842 ENSG00000039068/CDH1 0 + 68801743 68801743 0 1 99 0 chr16 69372320 69384641 ENSG00000132604/TERF2 0 - 69372320 69372320 0 2 35,62 0,12259 chr16 75656749 75656844 ENSG00000166848/TERF2IP 0 + 75656749 75656749 0 1 95 0 chr16 86569572 86569667 ENSG00000176692/FOXC2 0 + 86569572 86569572 0 1 95 0 chr16 88677848 88677939 ENSG00000185669/SNAI3 0 - 88677848 88677848 0 1 91 0 chr17 1775098 1775197 ENSG00000132386/SERPINF1 0 + 1775098 1775098 0 1 99 0 chr17 1891841 1891937 ENSG00000132383/RPA1 0 + 1891841 1891841 0 1 96 0 chr17 7283823 7284028 ENSG00000181856/SLC2A4 0 + 7283823 7283823 0 2 39,55 0,150 chr17 7674182 7674273 ENSG00000141510/TP53 0 - 7674182 7674182 0 1 91 0 chr17 8204746 8204841 ENSG00000178999/AURKB 0 - 8204746 8204746 0 1 95 0 chr17 15975421 15975514 ENSG00000170425/ADORA2B 0 + 15975421 15975421 0 1 93 0 chr17 28573433 28573537 ENSG00000109107/ALDOC 0 - 28573433 28573433 0 1 104 0 chr17 32490915 32491010 ENSG00000176749/CDK5R1 0 + 32490915 32490915 0 1 95 0 chr17 34256848 34256942 ENSG00000108691/CCL2 0 + 34256848 34256848 0 1 94 0 chr17 34994300 34994392 ENSG00000005156/LIG3 0 + 34994300 34994300 0 1 92 0 chr17 40291190 40291285 ENSG00000094804/CDC6 0 + 40291190 40291190 0 1 95 0 chr17 40456913 40457007 ENSG00000141753/IGFBP4 0 + 40456913 40456913 0 1 94 0 chr17 41523683 41523785 ENSG00000171345/KRT19 0 - 41523683 41523683 0 1 102 0 chr17 42910939 42911033 ENSG00000131482/G6PC 0 + 42910939 42910939 0 1 94 0 chr17 43044629 43044724 ENSG00000012048/BRCA1 0 - 43044629 43044629 0 1 95 0 chr17 47287124 47287222 ENSG00000259207/ITGB3 0 + 47287124 47287124 0 1 98 0 chr17 50097426 50097519 ENSG00000005882/PDK2 0 + 50097426 50097426 0 1 93 0 chr17 61685936 61686031 ENSG00000136492/BRIP1 0 - 61685936 61685936 0 1 95 0 chr17 68043103 68043198 ENSG00000182481/KPNA2 0 + 68043103 68043103 0 1 95 0 chr17 76723790 76723887 ENSG00000070495/JMJD6 0 - 76723790 76723790 0 1 97 0 chr17 78214366 78214730 ENSG00000089685/BIRC5 0 + 78214366 78214366 0 2 61,51 0,313 chr17 78854197 78854292 ENSG00000035862/TIMP2 0 - 78854197 78854197 0 1 95 0 chr17 82239027 82239131 ENSG00000141526/SLC16A3 0 + 82239027 82239027 0 1 104 0 chr18 22992893 22992988 ENSG00000101773/RBBP8 0 + 22992893 22992893 0 1 95 0 chr18 27952166 27952271 ENSG00000170558/CDH2 0 - 27952166 27952166 0 1 105 0 chr18 55226121 55226216 ENSG00000196628/TCF4 0 - 55226121 55226121 0 1 95 0 chr18 63318118 63318226 ENSG00000171791/BCL2 0 - 63318118 63318118 0 1 108 0 chr18 66284567 66284663 _GDC_CONTROL_21_/_GDC_CONTROL_21_ 0 + 66284567 66284567 0 1 96 0 chr19 541568 541673 ENSG00000099804/CDC34 0 + 541568 541568 0 1 105 0 chr19 1207139 1218443 ENSG00000118046/STK11 0 + 1207139 1207139 0 2 64,27 0,11277 chr19 4174471 4174582 ENSG00000077463/SIRT6 0 - 4174471 4174471 0 1 111 0 chr19 7626152 7626242 ENSG00000076924/XAB2 0 - 7626152 7626152 0 1 90 0 chr19 8374271 8374365 ENSG00000167772/ANGPTL4 0 + 8374271 8374271 0 1 94 0 chr19 10566734 10566825 ENSG00000129355/CDKN2D 0 - 10566734 10566734 0 1 91 0 chr19 12947905 12948000 ENSG00000179262/RAD23A 0 + 12947905 12947905 0 1 95 0 chr19 13961800 13961892 ENSG00000132005/RFX1 0 - 13961800 13961800 0 1 92 0 chr19 29822491 29822588 ENSG00000105173/CCNE1 0 + 29822491 29822491 0 1 97 0 chr19 34377801 34378958 ENSG00000105220/GPI 0 + 34377801 34377801 0 2 80,25 0,1132 chr19 40422732 40422823 ENSG00000197019/SERTAD1 0 - 40422732 40422732 0 1 91 0 chr19 41330675 41330768 ENSG00000105329/TGFB1 0 - 41330675 41330675 0 1 93 0 chr19 43552797 43552889 ENSG00000073050/XRCC1 0 - 43552797 43552797 0 1 92 0 chr19 45368692 45368968 ENSG00000104884/ERCC2 0 - 45368692 45368692 0 2 51,39 0,237 chr19 45421296 45421392 ENSG00000012061/ERCC1 0 - 45421296 45421296 0 1 96 0 chr19 47220845 47220937 ENSG00000105327/BBC3 0 - 47220845 47220845 0 1 92 0 chr19 48132997 48133095 ENSG00000105486/LIG1 0 - 48132997 48132997 0 1 98 0 chr19 48956257 48960852 ENSG00000087088/BAX 0 + 48956257 48956257 0 2 76,43 0,4552 chr19 49010557 49011034 ENSG00000183207/RUVBL2 0 + 49010557 49010557 0 2 54,36 0,441 chr19 49865328 49865424 ENSG00000039650/PNKP 0 - 49865328 49865328 0 1 96 0 chr19 58480869 58480975 ENSG00000083838/ZNF446 0 + 58480869 58480869 0 1 106 0 chr2 10444133 10444228 ENSG00000115758/ODC1 0 - 10444133 10444133 0 1 95 0 chr2 47483053 47483151 ENSG00000095002/MSH2 0 + 47483053 47483053 0 1 98 0 chr2 47800497 47800592 ENSG00000116062/MSH6 0 + 47800497 47800497 0 1 95 0 chr2 74892579 74892674 ENSG00000159399/HK2 0 + 74892579 74892579 0 1 95 0 chr2 99438656 99438751 ENSG00000135945/REV1 0 - 99438656 99438656 0 1 95 0 chr2 111123762 111123863 ENSG00000153094/BCL2L11 0 + 111123762 111123762 0 1 101 0 chr2 112830266 112830370 ENSG00000125538/IL1B 0 - 112830266 112830266 0 1 104 0 chr2 113133377 113133473 ENSG00000136689/IL1RN 0 + 113133377 113133377 0 1 96 0 chr2 127279176 127279271 ENSG00000163161/ERCC3 0 - 127279176 127279176 0 1 95 0 chr2 127322095 127322187 ENSG00000169967/MAP3K2 0 - 127322095 127322095 0 1 92 0 chr2 151464974 151465069 ENSG00000080345/RIF1 0 + 151464974 151464974 0 1 95 0 chr2 172564571 172564665 ENSG00000152256/PDK1 0 + 172564571 172564571 0 1 94 0 chr2 186625479 186625576 ENSG00000138448/ITGAV 0 + 186625479 186625479 0 1 97 0 chr2 189010203 189010296 ENSG00000168542/COL3A1 0 + 189010203 189010203 0 1 93 0 chr2 189034935 189035031 ENSG00000204262/COL5A2 0 - 189034935 189034935 0 1 96 0 chr2 189854347 189854442 ENSG00000064933/PMS1 0 + 189854347 189854347 0 1 95 0 chr2 201133072 201136014 ENSG00000003402/CFLAR 0 + 201133072 201133072 0 2 62,43 0,2899 chr2 205697558 205697650 ENSG00000118257/NRP2 0 + 205697558 205697558 0 1 92 0 chr2 215414845 215414944 ENSG00000115414/FN1 0 - 215414845 215414845 0 1 99 0 chr2 216122151 216122246 ENSG00000079246/XRCC5 0 + 216122151 216122151 0 1 95 0 chr2 224481895 224481990 ENSG00000036257/CUL3 0 - 224481895 224481895 0 1 95 0 chr2 227313707 227313802 ENSG00000169031/COL4A3 0 + 227313707 227313707 0 1 95 0 chr20 3805117 3805213 ENSG00000101224/CDC25B 0 + 3805117 3805117 0 1 96 0 chr20 10658503 10658601 ENSG00000101384/JAG1 0 - 10658503 10658503 0 1 98 0 chr20 31605299 31605394 ENSG00000125968/ID1 0 + 31605299 31605299 0 1 95 0 chr20 31722207 31722310 ENSG00000171552/BCL2L1 0 - 31722207 31722207 0 1 103 0 chr20 33366909 33367002 ENSG00000101391/CDK5RAP1 0 - 33366909 33366909 0 1 93 0 chr20 33676757 33676859 ENSG00000101412/E2F1 0 - 33676757 33676757 0 1 102 0 chr20 37055561 37055656 ENSG00000080839/RBL1 0 - 37055561 37055561 0 1 95 0 chr20 45894028 45894708 ENSG00000064601/CTSA 0 + 45894028 45894028 0 2 44,59 0,621 chr20 46012201 46012291 ENSG00000100985/MMP9 0 + 46012201 46012201 0 1 90 0 chr20 46129254 46129346 ENSG00000101017/CD40 0 + 46129254 46129254 0 1 92 0 chr20 49908432 49908526 ENSG00000158480/SPATA2 0 - 49908432 49908432 0 1 94 0 chr20 49988755 49988857 ENSG00000124216/SNAI1 0 + 49988755 49988755 0 1 102 0 chr20 56370080 56370178 ENSG00000087586/AURKA 0 - 56370080 56370080 0 1 98 0 chr20 57567078 57567172 ENSG00000124253/PCK1 0 + 57567078 57567078 0 1 94 0 chr20 59919493 59919588 ENSG00000196074/SYCP2 0 - 59919493 59919493 0 1 95 0 chr20 63694876 63695085 ENSG00000258366/RTEL1 0 + 63694876 63694876 0 2 98,20 0,189 chr20 63933464 63933559 ENSG00000101152/DNAJC5 0 + 63933464 63933464 0 1 95 0 chr21 20087007 20087107 _GDC_CONTROL_14_/_GDC_CONTROL_14_ 0 + 20087007 20087007 0 1 100 0 chr21 38824651 38824746 ENSG00000157557/ETS2 0 + 38824651 38824651 0 1 95 0 chr21 44327241 44327339 ENSG00000141959/PFKL 0 + 44327241 44327241 0 1 98 0 chr21 45512499 45512601 ENSG00000182871/COL18A1 0 + 45512499 45512499 0 1 102 0 chr22 21684767 21684861 ENSG00000100023/PPIL2 0 + 21684767 21684767 0 1 94 0 chr22 23894874 23895064 ENSG00000240972/MIF 0 + 23894874 23894874 0 2 70,25 0,165 chr22 28725030 28725124 ENSG00000183765/CHEK2 0 - 28725030 28725030 0 1 94 0 chr22 35393982 35394078 ENSG00000100292/HMOX1 0 + 35393982 35393982 0 1 96 0 chr22 35413874 35413977 ENSG00000100297/MCM5 0 + 35413874 35413874 0 1 103 0 chr22 37972841 37972936 ENSG00000100146/SOX10 0 - 37972841 37972841 0 1 95 0 chr22 41603280 41603374 ENSG00000100418/DESI1 0 - 41603280 41603280 0 1 94 0 chr22 41621991 41622085 ENSG00000196419/XRCC6 0 + 41621991 41621991 0 1 94 0 chr22 46329360 46329455 ENSG00000075218/GTSE1 0 + 46329360 46329360 0 1 95 0 chr3 4983679 4983777 ENSG00000134107/BHLHE40 0 + 4983679 4983679 0 1 98 0 chr3 8935915 8936011 ENSG00000070950/RAD18 0 - 8935915 8935915 0 1 96 0 chr3 9750021 9750114 ENSG00000114026/OGG1 0 + 9750021 9750021 0 1 93 0 chr3 14156348 14156449 ENSG00000154767/XPC 0 - 14156348 14156348 0 1 101 0 chr3 37050686 37050781 ENSG00000076242/MLH1 0 + 37050686 37050686 0 1 95 0 chr3 48158948 48159043 ENSG00000164045/CDC25A 0 - 48158948 48158948 0 1 95 0 chr3 48536358 48536460 ENSG00000114268/PFKFB4 0 - 48536358 48536358 0 1 102 0 chr3 49890485 49890584 ENSG00000164078/MST1R 0 - 49890485 49890485 0 1 99 0 chr3 51948541 51948636 ENSG00000041880/PARP3 0 + 51948541 51948541 0 1 95 0 chr3 55479460 55479555 ENSG00000114251/WNT5A 0 - 55479460 55479460 0 1 95 0 chr3 74811135 74811231 _GDC_CONTROL_06_/_GDC_CONTROL_06_ 0 + 74811135 74811135 0 1 96 0 chr3 122402763 122402859 ENSG00000114023/FAM162A 0 + 122402763 122402763 0 1 96 0 chr3 127619165 127619269 ENSG00000073111/MCM2 0 + 127619165 127619165 0 1 104 0 chr3 141959715 141959812 ENSG00000114126/TFDP2 0 - 141959715 141959715 0 1 97 0 chr3 142466431 142466526 ENSG00000175054/ATR 0 - 142466431 142466431 0 1 95 0 chr3 196055096 196055191 ENSG00000072274/TFRC 0 - 196055096 196055096 0 1 95 0 chr4 15936282 15936377 ENSG00000137440/FGFBP1 0 - 15936282 15936282 0 1 95 0 chr4 55113381 55113476 ENSG00000128052/KDR 0 - 55113381 55113381 0 1 95 0 chr4 73743438 73743533 ENSG00000169429/CXCL8 0 + 73743438 73743438 0 1 95 0 chr4 73981124 73981226 ENSG00000163737/PF4 0 - 73981124 73981124 0 1 102 0 chr4 77164291 77164386 ENSG00000138764/CCNG2 0 + 77164291 77164291 0 1 95 0 chr4 87981635 87981733 ENSG00000118785/SPP1 0 + 87981635 87981635 0 1 98 0 chr4 109694588 109694682 ENSG00000138794/CASP6 0 - 109694588 109694588 0 1 94 0 chr4 109824418 109824514 ENSG00000109534/GAR1 0 + 109824418 109824418 0 1 96 0 chr4 109983423 109983518 ENSG00000138798/EGF 0 + 109983423 109983423 0 1 95 0 chr4 120059541 120059636 ENSG00000164109/MAD2L1 0 - 120059541 120059541 0 1 95 0 chr4 121819410 121819505 ENSG00000145386/CCNA2 0 - 121819410 121819410 0 1 95 0 chr4 122892259 122892350 ENSG00000138685/FGF2 0 + 122892259 122892259 0 1 91 0 chr4 176711512 176711607 ENSG00000150630/VEGFC 0 - 176711512 176711512 0 1 95 0 chr4 177353424 177353519 ENSG00000109674/NEIL3 0 + 177353424 177353424 0 1 95 0 chr4 184629391 184629491 ENSG00000164305/CASP3 0 - 184629391 184629391 0 1 100 0 chr4 185399662 185399758 ENSG00000186352/ANKRD37 0 + 185399662 185399662 0 1 96 0 chr5 1282430 1282521 ENSG00000164362/TERT 0 - 1282430 1282430 0 1 91 0 chr5 34907711 34907806 ENSG00000113456/RAD1 0 - 34907711 34907711 0 1 95 0 chr5 36171625 36171720 ENSG00000145604/SKP2 0 + 36171625 36171625 0 1 95 0 chr5 40762887 40762982 ENSG00000132356/PRKAA1 0 - 40762887 40762887 0 1 95 0 chr5 56865873 56865968 ENSG00000095015/MAP3K1 0 + 56865873 56865873 0 1 95 0 chr5 60918285 60918381 ENSG00000049167/ERCC8 0 - 60918285 60918285 0 1 96 0 chr5 69174941 69175036 ENSG00000134057/CCNB1 0 + 69174941 69174941 0 1 95 0 chr5 69272897 69272992 ENSG00000134058/CDK7 0 + 69272897 69272897 0 1 95 0 chr5 69414357 69414452 ENSG00000152942/RAD17 0 + 69414357 69414357 0 1 95 0 chr5 69513999 69514091 ENSG00000197822/OCLN 0 + 69513999 69513999 0 1 92 0 chr5 80873141 80873236 ENSG00000113318/MSH3 0 + 80873141 80873141 0 1 95 0 chr5 83195825 83195920 ENSG00000152422/XRCC4 0 + 83195825 83195825 0 1 95 0 chr5 83490222 83490324 ENSG00000038427/VCAN 0 + 83490222 83490222 0 1 102 0 chr5 87408059 87408153 ENSG00000134480/CCNH 0 - 87408059 87408059 0 1 94 0 chr5 122075439 122075530 ENSG00000113083/LOX 0 - 122075439 122075439 0 1 91 0 chr5 132589677 132589772 ENSG00000113522/RAD50 0 + 132589677 132589677 0 1 95 0 chr5 133972516 133972611 ENSG00000213585/VDAC1 0 - 133972516 133972516 0 1 95 0 chr5 138286537 138286630 ENSG00000158402/CDC25C 0 - 138286537 138286537 0 1 93 0 chr5 138468269 138468364 ENSG00000120738/EGR1 0 + 138468269 138468269 0 1 95 0 chr5 142593155 142593250 ENSG00000113578/FGF1 0 - 142593155 142593155 0 1 95 0 chr5 151662334 151662428 ENSG00000113140/SPARC 0 - 151662334 151662334 0 1 94 0 chr5 163439360 163439456 ENSG00000113328/CCNG1 0 + 163439360 163439360 0 1 96 0 chr5 176881706 176881803 ENSG00000160883/HK3 0 - 176881706 176881706 0 1 97 0 chr5 178153796 178153890 ENSG00000145912/NHP2 0 - 178153796 178153796 0 1 94 0 chr6 7584482 7584577 ENSG00000096696/DSP 0 + 7584482 7584482 0 1 95 0 chr6 12293988 12294089 ENSG00000078401/EDN1 0 + 12293988 12293988 0 1 101 0 chr6 20490371 20490467 ENSG00000112242/E2F3 0 + 20490371 20490371 0 1 96 0 chr6 30743593 30743683 ENSG00000137331/IER3 0 - 30743593 30743593 0 1 90 0 chr6 31545336 31545428 ENSG00000213760/ATP6V1G2 0 - 31545336 31545336 0 1 92 0 chr6 31577964 31578059 ENSG00000232810/TNF 0 + 31577964 31577964 0 1 95 0 chr6 32195386 32195481 ENSG00000204301/NOTCH4 0 - 32195386 32195386 0 1 95 0 chr6 33314794 33314895 ENSG00000236104/ZBTB22 0 - 33314794 33314794 0 1 101 0 chr6 36687136 36687231 ENSG00000124762/CDKN1A 0 + 36687136 36687136 0 1 95 0 chr6 37174754 37174847 ENSG00000137193/PIM1 0 + 37174754 37174754 0 1 93 0 chr6 37368548 37368643 ENSG00000112130/RNF8 0 + 37368548 37368548 0 1 95 0 chr6 41935457 41935552 ENSG00000112576/CCND3 0 - 41935457 41935457 0 1 95 0 chr6 43786301 43786396 ENSG00000112715/VEGFA 0 + 43786301 43786301 0 1 95 0 chr6 45328325 45328419 ENSG00000124813/RUNX2 0 + 45328325 45328325 0 1 94 0 chr6 49786068 49786172 ENSG00000170950/PGK2 0 - 49786068 49786068 0 1 104 0 chr6 52278749 52278841 ENSG00000112118/MCM3 0 - 52278749 52278749 0 1 92 0 chr6 99543481 99543576 ENSG00000112237/CCNC 0 - 99543481 99543481 0 1 95 0 chr6 131949133 131949228 ENSG00000118523/CTGF 0 - 131949133 131949133 0 1 95 0 chr6 160702336 160706509 ENSG00000122194/PLG 0 + 160702336 160702336 0 2 17,103 0,4070 chr6 169217329 169217424 ENSG00000186340/THBS2 0 - 169217329 169217329 0 1 95 0 chr7 5999181 5999275 ENSG00000122512/PMS2 0 - 5999181 5999181 0 1 94 0 chr7 7641000 7641103 ENSG00000106399/RPA3 0 - 7641000 7641000 0 1 103 0 chr7 16783806 16783901 ENSG00000106537/TSPAN13 0 + 16783806 16783806 0 1 95 0 chr7 19116016 19116111 ENSG00000122691/TWIST1 0 - 19116016 19116016 0 1 95 0 chr7 22729541 22729643 ENSG00000136244/IL6 0 + 22729541 22729541 0 1 102 0 chr7 44065007 44065239 ENSG00000164708/PGAM2 0 - 44065007 44065007 0 2 5,124 0,108 chr7 45916556 45916651 ENSG00000146674/IGFBP3 0 - 45916556 45916556 0 1 95 0 chr7 47964494 47964589 ENSG00000136273/HUS1 0 - 47964494 47964494 0 1 95 0 chr7 81762714 81762809 ENSG00000019991/HGF 0 - 81762714 81762714 0 1 95 0 chr7 90164559 90164654 ENSG00000164647/STEAP1 0 + 90164559 90164559 0 1 95 0 chr7 92618087 92618185 ENSG00000105810/CDK6 0 - 92618087 92618087 0 1 98 0 chr7 93886424 93886519 ENSG00000105825/TFPI2 0 - 93886424 93886424 0 1 95 0 chr7 93921848 93921939 ENSG00000127920/GNG11 0 + 93921848 93921848 0 1 91 0 chr7 94430486 94430577 ENSG00000164692/COL1A2 0 + 94430486 94430486 0 1 91 0 chr7 95592847 95592941 ENSG00000004799/PDK4 0 - 95592847 95592847 0 1 94 0 chr7 100723304 100723398 ENSG00000130427/EPO 0 + 100723304 100723304 0 1 94 0 chr7 100819570 100819665 ENSG00000196411/EPHB4 0 - 100819570 100819570 0 1 95 0 chr7 101137499 101137595 ENSG00000106366/SERPINE1 0 + 101137499 101137499 0 1 96 0 chr7 106277154 106284895 ENSG00000105835/NAMPT 0 - 106277154 106277154 0 2 25,68 0,7673 chr7 116505981 116506071 ENSG00000105971/CAV2 0 + 116505981 116505981 0 1 90 0 chr7 116699713 116699808 ENSG00000105976/MET 0 + 116699713 116699713 0 1 95 0 chr7 124842851 124842943 ENSG00000128513/POT1 0 - 124842851 124842851 0 1 92 0 chr7 128254428 128254520 ENSG00000174697/LEP 0 + 128254428 128254428 0 1 92 0 chr7 134933127 134933221 ENSG00000122786/CALD1 0 + 134933127 134933127 0 1 94 0 chr7 143288525 143291639 ENSG00000106144/CASP2 0 + 143288525 143288525 0 2 4,100 0,3014 chr7 148766575 148766670 ENSG00000055130/CUL1 0 + 148766575 148766575 0 1 95 0 chr7 150995277 150996462 ENSG00000164867/NOS3 0 + 150995277 150995277 0 2 37,59 0,1126 chr7 152649199 152649294 ENSG00000196584/XRCC2 0 - 152649199 152649199 0 1 95 0 chr8 6521300 6521395 ENSG00000091879/ANGPT2 0 - 6521300 6521300 0 1 95 0 chr8 9761535 9761630 ENSG00000173273/TNKS 0 + 9761535 9761535 0 1 95 0 chr8 10765127 10765222 ENSG00000254093/PINX1 0 - 10765127 10765127 0 1 95 0 chr8 22177855 22177952 ENSG00000168487/BMP1 0 + 22177855 22177855 0 1 97 0 chr8 23191649 23191747 ENSG00000104689/TNFRSF10A 0 - 23191649 23191649 0 1 98 0 chr8 26408254 26408355 ENSG00000104765/BNIP3L 0 + 26408254 26408254 0 1 101 0 chr8 38060199 38060299 ENSG00000187840/EIF4EBP1 0 + 38060199 38060199 0 1 100 0 chr8 42369857 42369957 ENSG00000070501/POLB 0 + 42369857 42369857 0 1 100 0 chr8 47863430 47863525 ENSG00000253729/PRKDC 0 - 47863430 47863430 0 1 95 0 chr8 47977858 47977953 ENSG00000104738/MCM4 0 + 47977858 47977858 0 1 95 0 chr8 48920094 48920190 ENSG00000019549/SNAI2 0 - 48920094 48920094 0 1 96 0 chr8 73046251 73046351 ENSG00000147601/TERF1 0 + 73046251 73046251 0 1 100 0 chr8 89953308 89953403 ENSG00000104320/NBN 0 - 89953308 89953308 0 1 95 0 chr8 107284710 107284805 ENSG00000154188/ANGPT1 0 - 107284710 107284710 0 1 95 0 chr8 116866617 116866719 ENSG00000164754/RAD21 0 - 116866617 116866617 0 1 102 0 chr8 118924433 118924526 ENSG00000164761/TNFRSF11B 0 - 118924433 118924433 0 1 93 0 chr8 133238745 133238853 ENSG00000104419/NDRG1 0 - 133238745 133238745 0 1 108 0 chr8 142489339 142489432 ENSG00000181790/ADGRB1 0 + 142489339 142489339 0 1 93 0 chr9 21967908 21968003 ENSG00000147889/CDKN2A 0 - 21967908 21967908 0 1 95 0 chr9 22004556 22004651 ENSG00000147883/CDKN2B 0 - 22004556 22004556 0 1 95 0 chr9 27168507 27168602 ENSG00000120156/TEK 0 + 27168507 27168507 0 1 95 0 chr9 35681031 35681123 ENSG00000107159/CA9 0 + 35681031 35681031 0 1 92 0 chr9 77314506 77314601 ENSG00000197969/VPS13A 0 + 77314506 77314506 0 1 95 0 chr9 89316574 89316667 ENSG00000123975/CKS2 0 + 89316574 89316574 0 1 93 0 chr9 94593659 94593755 ENSG00000130957/FBP2 0 - 94593659 94593659 0 1 96 0 chr9 94620329 94620424 ENSG00000165140/FBP1 0 - 94620329 94620329 0 1 95 0 chr9 97687154 97687256 ENSG00000136936/XPA 0 - 97687154 97687154 0 1 102 0 chr9 99128937 99129032 ENSG00000106799/TGFBR1 0 + 99128937 99128937 0 1 95 0 chr9 100509011 100509106 ENSG00000241697/TMEFF1 0 + 100509011 100509011 0 1 95 0 chr9 101421799 101421889 ENSG00000136872/ALDOB 0 - 101421799 101421799 0 1 90 0 chr9 107330037 107330132 ENSG00000119318/RAD23B 0 + 107330037 107330037 0 1 95 0 chr9 127815324 127815419 ENSG00000106991/ENG 0 - 127815324 127815324 0 1 95 0 chr9 130886900 130886994 ENSG00000097007/ABL1 0 + 130886900 130886900 0 1 94 0 chr9 136920405 136920505 ENSG00000127191/TRAF2 0 + 136920405 136920405 0 1 100 0 chr9 137187675 137187772 ENSG00000176248/ANAPC2 0 - 137187675 137187675 0 1 97 0 chrX 15355159 15355254 ENSG00000165197/FIGF 0 - 15355159 15355159 0 1 95 0 chrX 19359695 19359790 ENSG00000131828/PDHA1 0 + 19359695 19359695 0 1 95 0 chrX 24503361 24503460 ENSG00000067992/PDK3 0 + 24503361 24503361 0 1 99 0 chrX 47584977 47585261 ENSG00000102265/TIMP1 0 + 47584977 47584977 0 2 38,57 0,227 chrX 54937670 54945478 ENSG00000158571/PFKFB1 0 - 54937670 54937670 0 2 54,40 0,7768 chrX 65739870 65739965 ENSG00000147065/MSN 0 + 65739870 65739870 0 1 95 0 chrX 78127867 78127961 ENSG00000102144/PGK1 0 + 78127867 78127867 0 1 94 0 chrX 123886153 123886248 ENSG00000101966/XIAP 0 + 123886153 123886153 0 1 95 0 chrX 136659333 136659427 ENSG00000102245/CD40LG 0 + 136659333 136659333 0 1 94 0 chrX 154769208 154769303 ENSG00000130826/DKC1 0 + 154769208 154769208 0 1 95 0